2004年年底，华纳公司以十张DVD的超大容量，将这套旷世奇作再度呈现给热爱它的影迷，一区除了普通十碟装外，还带有尼奥半身像的限量版。香港三区以相同的速度发行了这个套装，所有的花絮包括两条评论音轨在内都进行了翻译。而时隔一年多之后，六区这款豪华套装终于珊珊来迟，中国的“黑客迷”也终于可以拥有自己的圣经。
三部电影做了10张碟，内容之丰富令人咋舌，除了正片外，三部电影全部加上了评论音轨（我们将在下面详述），全部花絮内容长达35个小时。还加入《黑客帝国》动画版，众所周知，这个动画版对于理解黑客内涵有极其重要的作用。整部套装除了动画版改用D5外，其它内容与一区基本没有差别，尤其是尼奥的半身像完全来自一区限量版，极具珍藏价值。
此套装中三部正片的画质全部经过了重新修复。导演沃卓斯基兄弟果真没有食言，当初在套装面世之前所宣称的三集正片全部使用了高清晰母带进行全新修复，现在看来是没错的。新套装中三部曲正片全部制作了水准相当高的评论音轨各2条。由于众所周知的原因，导演兄弟俩不愿意参与影片的评论，他们这样只会让电影变得教条起来。但是他们在华纳的要求下，也给出了自己的折中解决办法，就是推荐了他们的好友，2位哲学家参与制作了第一条评论音轨，另外，还请到了独立影评人制作了第二条评论音轨。他们对影片的立场正好相反，非常有趣。
10张碟的内容：
第1张：THE MATRIX 黑客帝国 I（DVD9）
正片+两条评论音轨（一位哲学家和一位评论家的评论/ 带中文字幕）
第2张：THE MATRIX REVISITED 黑客帝国 重温（DVD9）
整部电影的拍摄花絮的短片 沃卓斯基兄弟在电影创造过程中挑选的电影配乐
第3张：THE MATRIX RELOADED 黑客帝国 重装上阵（DVD9）
正片+两条评论音轨 （一位哲学家和一位评论家的评论/ 带中文字幕）
第4张：THE MATRIX RELOADED REVISITED 黑客帝国 重装上阵 重温（DVD9）
跟随6条记录短片,重新体验冒险之旅
第5张：THE MATRIX REVOLUTIONS 黑客帝国 矩阵革命（DVD9）
正片+两条评论音轨 (一位哲学家和一位评论家的评论/ 带中文字幕)
第6张：THE MATRIX REVOLUTIONS REVISITED 黑客帝国 矩阵革命 重温（DVD9）
记录影片的广告和预告片和黑客电子音效
第7张：THE ANIMATRIX 黑客帝国 动画版（DVD5）
第8张：THE ROOTS OF THE MATRIX 黑客帝国 根源（DVD9）
追溯三部曲的历史，哲学和技术灵感
第9张：THE BURLY MAN CHRONICLES 斗士编年史（DVD9）
为三部曲和电脑游戏“进入母体”耗费多年心血的技术人员，演员和电影制作人的资料
第10张：THE ZION ARCHIVE 锡安档案（DVD9）
母体世界的所有内容，包括概念美术作品，情节画板，素描等等
碟片配置：金盘 IFPI码（废话，正版），9D9+1D5 尼奥半身像+黑客帝国手册
个人评价：正版的碟片实在是做得好，片源码率很高。这个版本和先前的版本不同的是，此版本是经过色彩修复了的，在MATRIX的世界变得更绿了，现实世界更蓝了，画面是没得说，花絮的完整性也无以伦比。不过为人诟病的是它的内置字幕，在DVD机上无法直接切换，这点很不爽（在DVD光驱中倒没问题）。再有就是菜单做得太没技术含量，静态的，除此之外，基本让我感到非常满意。这套碟是六区出过的少数精品之一，其它大部分六区正版都是垃圾，至于为何说正版是垃圾，以后我会再贴上来，欢迎收看
